Baikal.
Hack
Online, 19−20 декабря 2020 года

хакатон по биоинформатике для 9−11 классов
Регистрация
О чeм хакатон?
Как работает эволюция и как образовываются новые виды? Тема эта интересная, но учёным в ней многое пока неясно. Возможно, в ближайшие годы именно биоинформатикам удастся сделать много открытий в этой области.

Байкал славится своими эндемиками: в нем очень много специфичных видов с разными и интересными эволюционными историями. Сотни видов байкальских бокоплавов уже стали основой нескольких научных статей, а вот история 30 видов керчаковых рыб — бычков — пока остается неизвестной.
Задача
Проанализировать гены бычков биоинформатическими методами и сформулировать гипотезы об эволюционной истории генов и видов. Результаты нужно будет представить в формате научной статьи.
Что нужно для участия?
учиться в 9−11 классах школы. *
Необходимо и достаточно:
интересоваться молекулярной биологией и теорией эволюции на школьном уровне

* более младшим участникам будет трудно, а старшие могут участвовать вне конкурса
собрать команду из 3−4 человек или быть готовым работать в команде с другими участниками
Расписание хакатона
(время московское)
19 декабря 2020
20 декабря 2020
10.00 Открытие, постановка задачи, материалы
10.00 Мастер-класс по филогенетическим деревьям
11.00 Мастер-класс по базе данных ncbi и форматам генетических данных
11.00-14.00 Самостоятельная работа
14.00-15.00 Консультация с ментором
16.00 Сдача статей
18.00 Подведение итогов
12.00-18.00 Самостоятельная работа
18.00−20.00 Презентация предварительных материалов ментору
Что у вас будет
  • 3 вида глубоководных бычков
  • 3 вида обычных бычков
  • Неаннотированные последовательности из их транскриптомов, собранных в 2020 году
  • Описания биоинформатических методов, которые вам могут понадобиться
Что почитать, посмотреть и изучить перед хакатоном
Для участия в хакатоне важно понимать значение терминов
ДНК, трансляция, транскрипция, мутация, нуклеотид, рамка считывания, триплет, старт-кодон, синонимичные и несинонимичные замены, секвенирование, геном, вид, симпатрическое видообразование
- работа с базами данных последовательностей ДНК
- аннотация генов
- выравнивание последовательностей
- построение филогенетических деревьев
- визуализация 3D структуры белков
 — познакомятся с биоинформатическими методами:
 — опыт написания научных статей
 — классный исследовательский проект в малоизученной и передовой области
 — участие в хакатоне учитывается в конкурсе «Талант», победители которого получают до 10 баллов ЕГЭ
Что получат участники хакатона?
Организаторы
За предоставленные данные благодарим лабораторию молекулярной генетики ВНИРО и Байкальский Музей